Yoğurdun ekşimesi, genellikle laktik asit bakterilerinin aktivitesi sonucu meydana gelir. Bu bakteriler, yoğurtta bulunan laktozu (süt şekerini) parçalayarak laktik asit üretirler. Laktik asit seviyesi arttıkça yoğurdun pH değeri düşer ve bu da ekşi bir tada yol açar.
Ekşime sürecini hızlandıran bazı faktörler şunlardır:
Yoğurdun ekşimesi her zaman bozulduğu anlamına gelmez. Hafif ekşimiş yoğurt hala tüketilebilir durumda olabilir. Ancak, küflenme, kötü koku veya farklı bir renk değişimi gibi belirtiler varsa yoğurdun tüketilmemesi önerilir.